马桶也就是坐便器的冲水原理基本是直冲式冲水和虹吸式冲水两种大类。虹吸式冲水中又分旋涡式冲水、虹吸冲水和喷射式虹吸冲水。
直冲式马桶（座便器）
直冲式坐便器或马桶是利用水流的冲力来把粪便排出便便，一般池壁设计比较陡，池内存水面积较小，这样水力就比较集中，便圈四周围的冲下的水压力就会加大，冲污力极强效率也很高。
优点：直冲式坐便器或马桶冲水管路设计简单，冲水路径较短，管径设计得比较粗(一般直径设计在9至10厘米左右)，利用水的重力加速度原理作用就可以把马桶里的便便冲得干干净净，冲水的时间过程都很短，从冲污能力上与虹吸式相比较可以看出，直冲式座便器或马桶没有设计返水弯而是采取直冲方式，很容易就冲下较大的里面的污物，在冲刷过程中也不容易被造成堵塞，卫生间里不用备置纸篓也可以。从节约用水方面来说，直冲式马桶或座便器也比虹吸式坐便器好。
缺点：直冲式坐便器或马桶最大的设计缺陷就是冲水时声音比较大，还有就是由于里面存水面较小，容易结垢现象出现，防臭功能也不如虹吸式座便器或马桶好，另外，直冲式坐便器或马桶目前在市场上可供选择的品种比较少，选择面不如虹吸式座便器多。
虹吸式座便器或马桶
虹吸式坐便器或马桶的结构是排水管道设计呈“∽”型，在排水管道充满水后会在座便器或马桶里面产生一定的水位差，借冲洗水在便器内的排污管内产生的吸力把里面的粪便排走，由于虹吸式坐便器或马桶冲排原理不是借助水流冲力作用，所以池内的存水面积比较大，冲水时发出的噪音也比较小。虹吸式坐便器或马桶还可细分为旋涡式虹吸座便器或马桶、喷射式虹吸座便器或马桶两种。
（1）旋涡式虹吸马桶或座便器
这种坐便器或马桶冲水口设计在坐便器底部的一侧，冲水时水流会沿着池壁形成一个有冲力的旋涡，这样就会加大水流对池壁的冲洗磨擦的力度，也就加大了虹吸作用的吸力作用，这就更容易把马桶或座便器内的脏东西冲洗排出。
（2）喷射式虹吸马桶或座便器
是在虹吸式坐便器或马桶设计基础上做了进一步工艺技术改进，在马桶或座便器内底部增加一个喷射副道，对准马桶排污口的中心处，在给马桶冲水时，水的一部分会从便圈周围的布水孔流出，一部分从马桶喷射口喷出，这种坐便器是在虹吸的设计基础上借助较大的水流冲力，把污物快速冲走的。
优点：虹吸式坐便器或马桶的最大优点就是冲水时噪音较小，被称之为静音马桶或座便器。从冲污能力上看，虹吸式马桶会很容易就把黏附在马桶表面的污物冲掉，因为虹吸式马桶的存水面较高，防臭效果也就优于直冲式马桶，现在市面上虹吸式坐便器可供选购的品种较多，在购买坐便器或马桶时会有更多的选择余地。
缺点：虹吸式坐便器或马桶在冲水时先要把放水到很高的水面，然后才可以将污物冲下去，所以要具备一定水量后才可以达到冲净桶内污垢的目的，每次至少要用大约8升至9升水，相对来说这种马桶或座便器是比较费水的。 虹吸式的排水管直径的设计也只有大约5、6公分左右，冲水时容易被堵塞，所以手纸是不能直接扔在马桶里而直接冲水的，安装虹吸式坐便器或马桶一般还要配备纸篓和搋子。
